S.H.D.和51區的關系非常的微妙。

曼哈頓危機之前，S.H.D.僅僅只是CIA旗下的一個外包組織，這種小勢力基本不會得到51區的重視。

但伴隨著S.H.D.的高層全部‘意外死亡’，顧云繼承了S.H.D.，曼哈頓危機爆發之后，S.H.D.就開始大放異彩。

借著曼哈頓危機的機會，S.H.D.一下子從幕后站到了臺前，而且還神奇地找了聯合國做靠山，從等級上達到了和51區平起平坐的地位...