一聲爆炸之后，伊藤真司變成哥斯拉幫助初代奧特曼擊殺的第四十只怪獸終于倒下了。讓伊藤真司異常的感動，不禁回想起在這個世界變成哥斯拉與初代奧特曼一起擊殺的怪獸們！

第一只：第1話：奧特作戰第一號

科學特搜隊的早田進隊員在駕駛巡邏機工作時，突然發現一個紅色球體正追逐著藍色球體。紅色球體無意中撞上早田進的飛機，早田由此犧牲。隨后，早田進被吸入到紅色球體內，遇到了來自M78星云的宇宙英雄·奧特曼。并得知其為追擊宇宙怪獸·百慕拉而來到地球。奧特曼為補償早田遂決定與其合體與百慕拉一戰，并將自己的生命賦予了早田。最終，科學特搜隊用S16潛水艇攻擊使百慕拉浮出水面，早田變身為奧特曼后與百慕拉展開肉搏戰，最終大獲全勝。

第二只：第2話：打擊侵略者

20億3000萬巴爾坦星人在宇宙間旅行時，飛船的重力平衡出了問題，于是來到地球修理，因為地球有其修理重力平衡所需要的晶體二極管。但來到地球的巴爾坦星人被地球迷住，巴爾坦星人企圖對地球展開侵略。不過最終，巴爾坦星人的野心還是被奧特曼所粉碎。