根據2005—2007年對玉龍雪山地區常見的經濟植物進行調查，調查路線從海拔1800米的南麓虎跳峽，至海拔近4000米的高山流石灘，高差近3000米，常見的野生經濟植物有81科177屬387種。依據植物資源的類型劃分及其經濟用途，將區內野生經濟植物分為8類，其中藥用植物172種、花卉126種、芳香植物21種、油料植物19種、鞣料植物19種、纖維植物10種、淀粉和膠質淀粉植物10種、野果植物10種。

玉龍雪山常見藥用植物資源共31科90屬172種，其中金鐵鎖、云南重樓是云南白藥的主要原料。當歸、巖白菜等名貴、珍稀藥材種類比較豐富。

玉龍雪山海拔高差懸殊，具有寒、溫、熱3帶若干氣候類型，且濕度較大、日照多、紫外線充足，因而植物花大色艷，是云南高山花卉的主要產地，素有“天然花園”的美稱。常見的觀賞植物資源共有8科32屬126種，尤以杜鵑屬45種、報春花屬44種和龍膽屬36種植物居多。區內芳香植物資源涉及樟科、蕓香科等7科13屬21種。區內常見纖維植物有8科8屬10余種。

玉龍雪山常見的鞣料植物資源4科7屬19種。如松脂含量高的有云南松、華山松、高山松；可生產生漆的漆屬植物有5種，栲膠資源有板栗和青岡等，單寧含量在7%以上的樹種有水冬瓜和野核桃等，區內常見淀粉植物有5科5屬10種，如各種櫟類的果實。常見的野果植物資源有4科6屬10種。

玉龍雪山總面積為2.6萬公頃，天然林面積7663公頃，占總面積的29.5%；疏林地面積1235公頃，占總面積的4.8%；灌木林地2288公頃，占總面積的8.8%；無林地面積1269公頃，占總面積4.9%；非林地面積10545公頃，占總面積52%。主要有云南松林、鐵杉林、華山松林、高山松林、麗江云杉林、長苞冷杉林、大果紅杉林、小果垂枝柏林、櫟類林等森林類型，積量1857796立方米，森林覆蓋率為55%。

玉龍雪山已記錄到的主要野生經濟動物有59種，屬于獸類的有8目21科 42屬57種，多分布在高海拔和人跡少至的地方，有種類多、數量少的特點。其中屬國家重點保護的珍稀瀕危動物25種，其中國家級一類保護動物有：滇金絲猴、金錢豹、云豹、綠尾虹雉4種；二類保護動物有：獼猴、黑熊、小熊貓、石貂、大靈貓、小靈貓、鬣羚（野驢、蘇門羚）、斑羚（巖羊）、巖羊（青羊）、原麝、林麝、馬麝、藏馬雞、白鷴、紅腹角雉、金貓、穿山甲、水獺、毛冠鹿、白腹錦雞、鸚鵡21種。

玉龍雪山自然保護區當地和周邊有4個鄉12個村，有納西、漢、藏、彝、傈僳、白、普米等7個民族10000余人。早期的森林采伐、過度放牧、環境污染等人為活動的影響造成了保護區動植物棲息地面積減少、質量下降和破碎化，對野生動植物資源的生存和發展造成了嚴重影響。自然保護區成立，由于生產生活的需要，一些優良用材和觀賞樹木如云南榧樹、長苞冷杉、瀾滄黃杉、麗江鐵杉、棕背杜鵑等因過量采伐，林地生境惡化，植株數量極其有限，且多散生分布，天然更新困難，嚴重影響其正常生長。受市場高額利潤的驅使，一些珍貴藥材和花卉如蟲草、松茸、短柄烏頭、云南黃連、金蕎麥、喜馬拉雅紅豆杉、紅景天、黃牡丹、龍膽花、蘭花、綠絨蒿等因長期濫采亂挖，資源破壞嚴重，分布范圍日益減少，已瀕臨滅絕。

因傳統習慣或利益驅動，周邊社區村民非法進入保護區偷捕盜獵野生動物的現象也時有發生，在保護區偷捕盜獵的野生動物種類主要有野豬、巖羊、林麝、穿山甲、水獺等獸類和紅腹角雉、白腹錦雞、鸚鵡、畫眉、山斑鳩、竹雞等鳥類。

玉龍雪山自然保護區是中國少有的植物模式標本的集中產地，有800多種種子植物模式標本采集于此。國內外科研單位頻繁涌入，年進入玉龍雪山進行科學考察的人員達2000多人次。

玉龍雪山上有3條索道，活動范圍從海拔2400m的麗江古城擴大到了保護區核心的海拔4506m雪山冰川，每年接待的旅游客流量超出了玉龍雪山的接待能力。同時玉龍雪山旅游服務，活動范圍深入到了海拔3800~ 4000m的雪線附近。高山植被和野生花卉被游客踐踏、破壞；野生動物的數量急劇減少，滇金絲猴、野驢、黑熊等珍稀動物已難覓蹤跡。

1982年到2002年，玉龍雪山最大的白水1號冰川冰舌大約后退了250米，厚度和積雪面積也在減小。冰川末端海拔高度由2004年的4255米上升至2009年的4320米；海拔4680米處的冰川寬度由2004年的336米縮減為2009年的318米。全球氣候變暖是玉龍雪山冰川退縮的主要原因。

1957—1999年，玉龍雪山冰川消失了4條，總面積減少了3.11平方千米，冰川表面形態破碎嚴重，冰面破碎化趨勢已從消融區發展到積累區，2008年和 2009年在冰川積累區已形成冰面河和冰面湖等。

2001和2009年，玉龍雪山地區由1957年的19冰川縮減為13條，總面積由11.6平方千米分別減小為5.30平方千米和4.42平方千米，1957~2009年冰川年面積變化率為-1.19%，遠大于中國其他典型冰川區冰川面積年變化率。

2011年，白水1號冰川表面已陸續發育為一系列規模較大的冰裂隙，冰體凍結能力降低，冰緣帶巖體穩定性下降，誘發了2004和2009年玉龍雪山漾弓江5號冰川的崩塌。

甘海子位于玉龍雪山東麓，原為高山冰蝕湖泊，后因雪線上升，積水減少以至干涸，人稱“干海子”，是一個三面環山的高原草甸，整個大草甸長約4公里，寬約1.5公里。

藍月谷玉龍雪山冰雪融化成河水從雪山東麓的一條山谷而過，因月亮在藍天的映襯下倒影在藍色的湖水中，又因英國作家希爾頓筆下的《消失的地平線》中的藍月亮山谷近似于此。故名“藍月谷”。

藍月谷中的河水在流淌過程中因受山體阻擋，形成了4個較大的水面，人稱玉液湖、鏡潭湖、藍月湖和聽濤湖。湖岸四周植被繁茂，遠處雪峰背襯。

滑雪場位于扇子陡東坡下，海拔在4500-4700米之間，四季積雪，東西向長1000米，南北向寬600米，且雪質好，適合四季滑雪。是世界上最溫暖的滑雪場，中國一年中滑雪時間最長的滑雪場。

白水河，從干海子到云杉坪之間，有一條山谷，谷內林木森森，清溪長流，谷底清泉長流的河，叫白水河。因河床、臺地都由白色大理石、石炭石碎塊組成，呈一片灰白色；清泉從石上流過，亦呈白色，因色得名“白水河”。白水河之水來源于四五千米高處的冰川雪原融水。

云杉坪海拔3240米，是玉龍雪山東面的一塊林間草地，約0.5平方公里，海拔3000米左右。納西語稱為“吾魯游翠閣”，意為殉情之地，在納西東巴經典《魯般魯饒》中，曾把云杉坪描繪成白鹿當耕牛、赤虎當坐騎、雉鳥來報曉、白雪釀美酒、樹上結金果、潔凈無蒼蠅的理想樂園，即納西族傳說中的“玉龍第三國”。

牦牛坪納西語稱為“閣展古”（閣是高山草甸，展為有如星朵羅列，古為一方或一隅），意思是一方有如星朵羅列的高山草甸。海拔為3700米，一年四季風景如畫。

兩天之后。一對俊美的男女。行走在這座富有神話興致的雪山之上！

“老公，你現在，真是越來臉皮越厚了，原本你還裝著一點，現在，怎么，你這都已經開始照著手機。給我讀了是吧！”玉如櫻氣憤的說道！

“嘿嘿，這不是，比較官方嘛，你要知道，這可是最為官方的記載！哎呦！如櫻，你得溫柔一點！哎呦，你還打我。哎呦。如櫻啊，得得，我給你說一下關于這里的神話傳說吧怎么樣，求放過！”