- GraphPad Prism學術(shù)圖表(全彩)
- 張敏
- 1708字
- 2021-05-19 17:55:47
2.1.3 GraphPad Prism自定義的8種數(shù)據(jù)表
1. XY表
在XY表中,每組數(shù)據(jù)由X值和Y值組成,X軸和Y軸既可以用于展示連續(xù)數(shù)據(jù),也可以用于展示分類數(shù)據(jù)。如果X值和Y值同等重要,則兩者共同定義數(shù)據(jù)點在二維空間的位置,這尤其適用于散點圖或直線連接的散點圖,如圖2-1-7(a)和圖2-1-7(b)所示。如果X值持續(xù)有序變化,如表示時間變化,數(shù)據(jù)展示將側(cè)重于Y值,則除了直線連接的散點圖,柱狀圖也可以達到展示目的,如圖2-1-7(c)和圖2-1-7(d)所示。但如果X軸用于展示分類數(shù)據(jù),且標簽名稱過長,則將柱狀圖換成水平方向的條形圖是更好的選擇。如果X值等距有序變化,如某個身高區(qū)間,則Y軸可能會用于展示頻數(shù),變成直方圖。同時如果X值等距有序變化,數(shù)據(jù)展示將側(cè)重于Y值的變化和Y值的累計和,則線下面積圖是理所當然的選擇,如圖2-1-7(e)和圖2-1-7(f)所示。XY表中兩個變量的側(cè)重不同,展示方式也隨之不同,所以XY表下可繪制的圖形種類是整個軟件中最多的(見圖2-1-7)。

圖2-1-7 XY表下可繪制的部分圖形
2. Column(縱列表)
縱列表也叫作一維分組表,使用二維矩陣中的列對數(shù)據(jù)進行分組,側(cè)重于分組下的多個Y值的統(tǒng)計量,如平均數(shù)、幾何平均數(shù)和中位數(shù)等。所以縱列表下可繪制的圖形主要是柱狀圖、水平向的條形圖、誤差線圖、箱線圖和小提琴圖等,如圖2-1-8所示。

圖2-1-8 縱列表下可繪制的部分圖形
3. Grouped(行列分組表)
行列分組表也叫作二維分組表,行和列都是分組因素。在行列分組表中,行和列往往展示了每組數(shù)值的統(tǒng)計量,都使用柱狀圖來表示。由于行和列的展示同等重要,因此在二維坐標系里面安排行和列的分組因素往往會形成在柱狀圖上的4種表現(xiàn)形式:分隔(Separated)或分組(Grouped)、交錯(Interleave)、堆積(Stacked)和疊印(Superimposed),分別如圖2-1-9所示。分隔和交錯按字面意思及圖示很容易理解,但是堆積和疊印需要注意區(qū)分。堆積是把代表各自數(shù)據(jù)的矩形條在一個維度上相連,沒有重疊部分;而疊印是把代表各自數(shù)據(jù)的矩形條前后重疊,在重疊之后不利于展示被遮擋的數(shù)據(jù)。除了柱狀圖,行列分組表下數(shù)值的統(tǒng)計量同樣可以使用誤差線圖、箱線圖、小提琴圖等來表示。

圖2-1-9 行和列的分組因素在柱狀圖上的4種表現(xiàn)形式
4. Contingency(列聯(lián)表)
列聯(lián)表是一種特殊的頻數(shù)統(tǒng)計表,從數(shù)據(jù)組織結(jié)構(gòu)來看,與行列分組表類似。但與行列分組表不同的是,列聯(lián)表中只能展示兩個或多個變量分類時所列出的實際頻數(shù),而不能展示計算后的統(tǒng)計量、小數(shù)或百分數(shù)。這是為了與其內(nèi)置的卡方檢驗相對應(yīng),一般可以繪制分隔、交錯和堆積柱狀圖,而疊印柱狀圖需要在這3種柱狀圖的基礎(chǔ)上更改模式,這與行列分組表的要求完全一樣。
5. Survival(生存表)
生存表是為生存分析所設(shè)置的一類表格,主要用于生存分析和生存曲線繪制,如圖2-1-10所示。
6. Parts of whole(局部整體表)
局部整體表主要用于繪制餅圖、環(huán)形圖。
7. Multiple variable(多變量表)
多變量表的每一列代表一個變量,每一行代表一個個體或一次試驗,在數(shù)據(jù)組織結(jié)構(gòu)上與行列分組表相同,但不能設(shè)置子列,沒有專門對應(yīng)的可繪制圖形。多變量表主要用于安置高級統(tǒng)計分析方法,如多元線性回歸(Multiple linear regression)、多元Logistic回歸(Multiple logistic regression)、泊松回歸(Poisson regression)及相關(guān)性矩陣計算(Correlation matrix)。

圖2-1-10 生存分析和生存曲線繪制
8. Nested(嵌套表)
嵌套表也被翻譯為巢式數(shù)據(jù)表,是GraphPad Prism 8以上版本提供的一種新的數(shù)據(jù)表。嵌套表在數(shù)據(jù)組織結(jié)構(gòu)上類似于帶子列的縱列表,但兩者存在明顯區(qū)別:縱列表的每一個子列代表一個生物學重復,每一列堆疊在一起的數(shù)據(jù)表示多次測量;而嵌套表的每一行代表一個生物學重復,每一行的子列數(shù)據(jù)表示技術(shù)重復。嵌套表主要用于解決嵌套數(shù)據(jù)的統(tǒng)計分析和圖形繪制,繪制的圖形與縱列表下的柱狀圖類似,不過為了表示嵌套,會在不同分組之間以直線隔開。
需要注意的是,無論是按照圖表外觀分類,還是按照圖表展示的數(shù)據(jù)關(guān)系分類,都很難實現(xiàn)100%的邊界清晰度,因為總會有交叉的地方。柱狀圖包括條形圖和直方圖,是用于展示對比和分布關(guān)系的數(shù)據(jù)圖,堆積(百分比)柱狀圖還可以用于展示構(gòu)成關(guān)系的數(shù)據(jù);散點圖既可以用于展示數(shù)據(jù)的分布關(guān)系,也可以用于展示兩個變量之間的聯(lián)系。
GraphPad Prism按照數(shù)據(jù)表的形式對圖表進行分類時也有類似的問題。比如,XY表可以繪制散點圖、折線圖、柱狀圖、面積圖;而柱狀圖如果涉及單數(shù)據(jù)系列和多數(shù)據(jù)系列,則使用的數(shù)據(jù)表會涉及縱列表和行列分組表。
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