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1.4.1 圖形繪制區的修飾和美化

圖形繪制區是指由XY軸圍成的區域。圖形樣式(填充和描邊)、誤差線樣式、圖例、誤差標志等內容都是在這個區域中實現的。在圖形繪制區的任意位置雙擊或者在工具欄的Change選項組中單擊圖標,即可進入Format Graph界面,如圖1-4-3所示,可以進行4個方面的設置:Appearance(外觀)、Data Sets on Graph(圖形數據集)、Graph Settings(圖形設置)、Annotations(注釋)。

圖1-4-3 Format Graph界面

(1)Appearance(外觀):在該選項卡中先選擇需要修改的單個圖形元件對應的數據集(Data set),如圖1-4-4所示,本例(Col:Unpaired t test data)中涉及男性(Col:Unpaired t test data:A:Male)和女性(Col:Unpaired t test data:B:Female)兩組數據。在GraphPad Prism9中,軟件自帶數據會在前面加上表示數據表類型的縮寫前綴,比如,本例中的Col:表示Column,即縱列表,而之前的軟件版本則沒有這個前綴。GraphPad Prism中的數據集命名方式為“數據表名+字母標記+分組名”,由于采用這個命名方式得到的名稱比較長,在本書中一般以字母標記來指示數據集,比如,本例中有A、B兩列數據或者說有A、B兩個數據集,分別對應兩個柱狀圖。如果是單擊圖形繪制區的空白區域進入Format Graph界面的,要對其中一個柱狀圖進行修改,則需要先選擇對應的數據;如果是直接在需要修改的柱狀圖(或其他圖形)上雙擊進入Format Graph界面的,則軟件會直接選好對應的數據集。

選好對應的數據集之后,再確定單個圖形的整體Style(樣式):如圖1-4-4所示,在Appearance(外觀)下拉列表中可以對單個圖形(本例為柱狀圖)樣式進行修改,如改成Violin plot(小提琴圖)樣式;在Plot(畫圖)下拉列表中可以對外觀樣式做進一步修改,如該選項默認是Violin plot only(小提琴圖),但也可以選擇Violin plot.Show all points(顯示點的小提琴圖)選項。

圖1-4-4 Format Graph界面(Appearance選項卡)

選好數據集和整體樣式之后,剩下的就是細節修改,不同的整體樣式對應的可修改細節有所不同。如圖1-4-5所示,若將Plot設置為Violin plot.Show all points(顯示點的小提琴圖),則可以進行的修飾如下所述。

? Violin plot(小提琴圖):可以修改Fill(填色)、Border(邊線粗細)、Border color(邊線顏色)及Smoothing(小提琴圖的平滑度)選項,如果勾選了Fill pattern(圖案)復選框,還可以對圖案的種類和顏色進行選擇。

? Symbols(符號):數據所代表的點的外觀修改,包括Color(填充顏色)、Shape(形狀)、Placement[放置,可以錯開(Staggered)或重疊(Aligned)]、Size(大小)選項,如果設置的符號有邊線,還可以設置Border color(邊線顏色)和Border thickness(邊線粗細)選項。

? Quartiles(四分位線):小提琴圖可以被看作核密度圖與箱線圖的結合,所以還會顯示四分位線,在此可以設置上下四分位線的顏色(Color)、線條樣式(Pattern)和粗細(Thickness)。

? Median(中位線):可以設置中位線的顏色(Color)、線條樣式(Pattern)和粗細(Thickness)。如果帶有誤差線,還可以對誤差線進行誤差線朝向(Line and error go)、樣式(Style)和長度(Length)的設置。

? Additional options(其他選項):可以設置圖形是基于左Y軸還是右Y軸繪制的、是否顯示圖例(Show legend)以及是否以行名來標記每個點。

圖1-4-5 圖形樣式細節修改

(2)Data Sets on Graph(圖形數據集):該選項卡主要用于控制構成單個圖形的數據集(Data set)以對單個圖形進行修改,包括Add(增加)、Replace(替換)、Remove(移除)及Reorder(排序)等操作,如圖1-4-6所示。

圖1-4-6 Format Graph界面(Data Sets on Graph選項卡)

圖1-4-7依次展示了對本例之前獲得的單個圖形(柱狀圖和小提琴圖)數據集進行增加、移除、替換、反向及分隔等操作。

圖1-4-7 對單個圖形數據集的常見操作

此外,選擇非頂端的數據集,還可以進行間隔和分割線的設置,如圖1-4-8所示。

圖1-4-8 間隔和分隔線設置

(3)Graph Settings(圖形設置):該選項卡用于對圖形整體進行設置。如圖1-4-9所示,包括Direction(圖形方向)、Baseline(基線)、Dimensions(尺寸,可以設置各圖形之間的間距)、Discontinuous axis(不連續坐標軸)、Scatter plot appearance(散點圖外觀)、Shape of legend key(圖例圖形形狀)等方面的設置。

圖1-4-9 Format Graph界面(Graph Settings選項卡)

(4)Annotations(注釋):該選項卡主要用于設置數據標簽的展示形式。如圖1-4-10所示,本例分別在誤差線之上、柱形圖頂部或柱形圖底部展示構成單個圖形的數據標簽,并且數據標簽的形式,如方向、格式、小數位數、字體、顏色等都可以在該選項卡中設置。

圖1-4-10 Format Graph界面(Annotations選項卡)

如圖1-4-11所示,在單個圖形的任意位置右擊,在彈出的快捷菜單中也有一些修改命令,主要是用于進行格式設置的快捷操作命令,可以分為以下4類。

圖1-4-11 快捷菜單

格式設置類:包括對單個點(Format This Point)、整個數據集(Format Entire Data Set)和所有數據集(Format All Data Sets)的格式進行設置,如填色、描邊、填充圖案等選項。

數據集操作類:包括從圖形中移除數據集(Remove Data Set from Graph)、替換數據集(Replace Data Set)、僅保留該數據集(Keep Only This Data Set)3種操作。

數據集順序操作類:包括反向數據集順序(Reverse Data Set Order)、反向圖例順序(Reverse Legends Order)、右移數據集(Move Data Set Right)、左移數據集(Move Data Set Left)4種操作。

更換繪圖坐標軸類:選擇Plot Data Set On(數據繪圖于)命令,然后選擇數據繪制在左Y軸還是右Y軸,并對圖形所在數據集進行編輯(Edit),進入Format Graph界面。

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