皇后與皇帝離宮祈福，華貴妃獨掌六宮，大權在握。
華貴妃自然是要好好收拾一番陵容與甄嬛二人的，只是陵容如今挺著老大的肚子，華貴妃也不敢過多為難，可甄嬛還不顯懷，華貴妃又暗地里打聽到三個月的婦人，跪一跪也不打緊，索性以甄嬛對自己不敬為由，罰甄嬛跪在地上。
碧答應維護甄嬛，可碧答應同意也是華貴妃眼中釘，自然是一同受罰了，碧答應心里自然是恨極了華貴妃的。
甄嬛這一跪就是一個時辰，直到屬實是受不住，暈了過去，華貴妃才意識到甄嬛可能出了問題，遂既召太醫診治甄嬛，可是終究還是晚了，甄嬛的胎沒保住。
甄嬛久跪小產，皇帝與皇后聞訊策馬趕回宮中。甄嬛失子，皇帝自責不已，皇后在一旁安慰。
華貴妃得知甄嬛小產自知罪孽深重，在曹貴人勸說下只得脫簪請罪。
皇帝大怒，廢其華貴妃之位，褫奪封號，降為妃位，并責罰其每日正午跪于翊坤宮門外兩個時辰思過。
皇帝顧及朝政與年羹堯的勢力，不能依甄嬛所愿殺掉華妃，甄嬛心灰意冷。
年羹堯得知妹妹華妃失寵后上書諫言，向皇帝直言冷落妹妹會使年氏一族寒心，令其地位不穩。皇帝處于兩難境地，找來果郡王探其口風，果郡王以“不在其位，不謀其政”為由推脫，消除了皇帝的疑心。
甄嬛沉浸在失子之痛中，不能自拔，槿汐勸慰，甄嬛埋怨皇帝的言語被前來探望的皇帝聽到，止步不前。皇帝心中郁結，來到太后處，訴說是自己當年賜給年妃的歡宜香導致甄嬛流產的，自責不已，太后寬慰皇帝。
甄嬛失了孩子，自是傷心不已，可偏偏此時太醫又發現甄嬛體內有用過麝香的痕跡，甄嬛疑心華妃宮中歡宜香有問題，命流朱取來歡宜香，果真從歡宜香中發現了麝香的痕跡。
皇帝前來探望甄嬛，甄嬛仍舊對歡宜香一事耿耿于懷，兩人心生隔閡，皇帝拂袖離去。
為寬解皇帝連失兩子的抑郁，皇后安排宮中宴飲，宴中，皇上發現了平日里沒發現的嬪妃美貌與才華，自然喜不自勝，后宮眾人也才放了心，只要皇上愿意寵幸她們，她們自然還是有未來的。
陵容月份已經很大了，自然沒有來參與宴會，正巧此時，華妃欲要見皇上，剛上船，便有宮人稟報皇上，陵容要生產了，皇上聽聞大喜，遂與皇后攜眾嬪妃離開，華妃撲了個空，心里也更恨陵容，回宮后拿曹貴人出氣，曹貴人對華妃恨之入骨，卻又無能為力。
陵容安然生下一個皇子，起名為弘湛，皇后見陵容如今有了孩子，自然是能親自撫養的好。
“安貴人如今也有了皇子，若是能夠親自撫養，想來也是歡喜的吧，再者說，安貴人親自撫養孩子，總比阿哥所的宮人用心”
皇上因著自己兒時的經歷，自然也是不愿自己兒子也與母親分開的。
“那依皇后之見，朕給容兒一個什么位分好？”
“臣妾以為，安貴人侍奉皇上多年有功，如今又誕下皇子，不如晉為嬪，入主延禧宮”皇后笑著說道“至于封號還是要皇上來擬才是最好的”
“皇后都這么說，朕自然是允了，至于封號，不如就順吧，順嬪”
生下皇子的陵容得知自己晉為順嬪，知道這都是皇后都功勞，自然很是感激，也知道自己如今有了皇子，自然會成為某些人的靶子，自然是在宮里好好養育自己的孩子。
而此時的甄嬛傷心過度不能自拔，含淚睡去；皇帝看見以為甄嬛仍深怨自己，傷感愧疚之下再不踏足碎玉軒，甄嬛完全失寵。
甄嬛與槿汐前往延慶殿探望端妃，感嘆其遭遇，請來太醫盡力救治端妃。
長街上，落寞的甄嬛撞倒富察貴人，引來富察貴人挑釁；富察貴人命失勢的甄嬛跪于長街，并讓宮女煽其臉面。
甄嬛終于認清眼前殘酷的現實，為了重獲皇帝的喜歡，要流朱等人在冬天找來蝴蝶，眾人卻疑心甄嬛瘋癲。流朱只得求助果郡王，果郡王愿意滿足甄嬛的一切要求，為她尋來蝴蝶。
甄嬛在眾人的協助下，引來前往倚梅園祈福的皇帝；皇帝眼見蝴蝶圍繞甄嬛紛紛飛舞，美不勝收，即刻為其傾倒，甄嬛得寵翻身。
甄嬛欲擒故縱，連續多日借口拒絕皇帝寵幸，卻反而更加得到皇帝的眷顧。
皇帝拿她無計可施，便找來果郡王商議，不料尚未娶妻的果郡王一語道破皇帝的心意，皇帝內心寬解，果郡王卻十分落寞。
準葛爾使者入宮求親，皇帝認定“攘外須得安內”，將先帝幼女朝瑰公主嫁給準葛爾可汗；甄嬛向皇后提議曹貴人細心，適宜協助公主準備嫁妝。皇后見皇帝對甄嬛言聽計從，甚為擔憂，卻苦無良策應對。曹貴人眼見痛不欲生的朝瑰公主，兔死狐悲，心驚不已。
不料，準葛爾老可汗娶得朝瑰三日后便暴斃，公主按當地習俗下嫁給老可汗之子。甄嬛轉述公主近況，以溫宜前途撼動曹貴人。
甄嬛為了家族前途，終于同意皇帝夜宿碎玉軒。
甄嬛以“人彘”之事逼瘋富察貴人，同時威懾曹貴人；曹貴人迫于甄嬛的壓力，暫時向其低頭，把年妃收受宮外賄賂之事告知甄嬛。
敦親王勞軍歸來戎裝進殿，御史張霖彈劾其大不敬之罪，被敦親王報復打昏，引起文臣激憤；敦親王稱病拒絕上朝，皇帝為難。甄嬛向皇帝提議借福晉之手勸敦親王上門道歉，并自請前往說服福晉相助。
皇帝根據甄嬛的的提議，為安撫敦親王，加封了其子女，并提議由太后撫養其女兒以作人質。敦親王不解內情，在福晉勸服下勉強道歉。
甄嬛以茶葉之事告知皇帝宮中貢品都是先入年羹堯與敦親王府邸，剩余的才送入宮中，建議皇帝不必動怒，而將此事刻意宣揚出去，使年羹堯和敦親王等人失盡人心。皇帝欣賞甄嬛政治才能，允許她單獨與自己商議政事。