話說鴻蒙初始，天地一片混沌虛無，若干年后，忽然生出一棵蓮花，那青蓮生五片蓮葉，開花二十四瓣，結成一顆蓮子。億萬年后，蓮子裂開，乃生盤古大神，盤古大神因不滿混沌中的無盡壓抑，遂執開天斧將天地劈開。

天地初開后，由于天地不穩，盤古大神乃頭頂青天，腳踏大地，每日身體長高一丈，同時天也高一丈，地也厚一丈，十萬八千年后，天極高，地極厚，盤古大神有感于天地間萬物虛無，便身化洪荒：左眼為日，右眼為月，頭發化為點點繁星；血脈化為江河湖海，肌肉化成沃野良田；骨骼化為巨木，汗毛化為花草，筋脈化為通衢道路；牙齒化為金石，精髓化為珍珠；氣為風云，聲作雷霆，汗成雨露；

盤古大神倒下時，頭與四肢化成了五岳，而脊梁卻成了聯通天地的天柱不周仙山，后來公共怒撞不周山，導致天殘地缺，不周山隨被稱作昆侖山，原本的山體為東昆侖，為玉清元始天尊的道場，而被撞斷的山體則堆積到了昆侖以西，仍以昆侖為號，稱為西昆侖，為太清太上老君的道場。

在盤古大神倒下的瞬間，從身上逸出三道清氣和十二道濁氣。

三道清氣上升化為太清太上老君、玉清原始天尊、上清通天道人。

十二道濁氣下降化為十二祖巫，分別為：

蓐收：金之祖巫。

句芒：木之祖巫。

共工：水之祖巫。

祝融：火之祖巫。

天吳：風之祖巫。

玄冥：雨之祖巫。

強良：雷之祖巫。

翕茲：電之祖巫。

帝江：空間速度之祖巫。

燭九陰：時間之祖巫。

奢比尸：天氣之祖巫。

后土：土之祖巫。

開天斧因承受不住開天的阻力，斧頭化成了太極圖、盤古幡，斧刃化成了誅仙四劍，斧柄化成了混沌鐘，合稱四大先天至寶！

而混沌青蓮亦因天地開裂而毀損，二十四瓣蓮花化成二十四片造化玉牒，上面記載著大道三千，后為鴻鈞所得，并籍此悟道。

混沌青蓮的五片葉子化成了十大先天靈寶為五行旗（中央戊己杏黃旗、東方青蓮寶色旗、南方離地焰光旗、西方素色云界旗、北方玄元控水旗）、乾坤鼎、十二品蓮臺、山河社稷圖、河圖洛書、七寶妙樹、天書（封神榜）、地書、冥書（生死薄）、紅繡球；蓮莖化為一萬三千五百斤的如意金箍棒。

巫族天生能掌控各洪荒元素，尤以各種護體神通和靈魂攻擊手段而知名，但是卻不能生化，不煉元神，資質又普遍較低，大多千年萬年而無法提升境界。

盤古左目所化太陽星中，帝俊攜先天靈寶河圖洛書出世，太一執先天至寶混沌鐘而生，帝俊與太一曾于紫宵宮中聽鴻鈞講道，修煉得一身超凡入圣的本領，后于三十三天外建立妖皇宮，帝俊自號妖皇、太一自號東皇，統領天下妖族，一時風頭無兩。巫妖兩族是天生冤家，互斗幾百萬年，死傷無數，后來兩族終為了爭奪天地的統治權利，展開生死決戰。結果十二祖巫盡皆隕落。

在隕落的十二祖巫中，燭九陰的一靈得通天教主幫助，得以重塑肉身，號為祖龍，傳下洪荒龍族一脈，育有四海龍族和旁支九族，即囚牛、睚眥、嘲風、蒲牢、狻猊、霸下、狴犴、負屃、螭吻。

而妖族的兩位妖皇也盡皆隕落，后來東皇太一轉世重生，道號太乙真人，拜元始天尊為師，但至寶混沌鐘卻從此下落不明。

實力大損之際，妖族幸存族人盡皆歸順妖族圣人女媧、伏羲，后女媧造人，伏羲見女媧因摶土造人而成圣，為求證混元，乃轉世為人，后因大功德為太上老君所點化，立地成圣，號為人皇。女媧則獨掌天下妖族，并與人族建立同盟。

此后，巫族英雄蚩尤率眾崛起，攻打妖族，彼時妖族首領炎帝率眾反抗，卻遭遇失敗，乃向人族求救，人族軒轅黃帝率領人、妖兩族共抗巫族，殺蚩尤及兄弟八十一人于中冀。

后元始天尊命廣成子點化軒轅黃帝，使其飛升，并被允許在人族中傳道，乃建闡教玉虛宮。而通天教主則受女媧所托，在妖族中傳道，建立截教。

黃帝大戰蚩尤之后千年，人、妖兩族欣欣向榮，而巫族卻不知所蹤，鴻鈞老祖乃命人族出身的準圣張百忍為昊天上帝，妖族出身的西王母為瑤池金母，組建天庭，掌管整個三界，昊天上帝乃發符文，命十二仙首稱臣，并著人、闡、截三教簽押封神榜，冊封三百六十五位正神。