異基因造血干細胞移植（allo-HSCT）是血液系統疾病，尤其是惡性血液病有效乃至唯一的根治手段。涵蓋免疫耐受和免疫重建等在內的免疫學問題是allo-HSCT的核心科學問題。免疫學在臨床上涉及造血干細胞（HSC）植入和（或）移植排斥、病原微生物感染的發生及轉歸、移植物抗宿主病（GVHD）、移植物抗白血病（GVL）效應以及移植后的固有和適應性免疫重建等諸多問題。明確供者免疫細胞對受者細胞上表達的主要和（或）次要組織相容性抗原發生的免疫識別和免疫反應的本質對于解決移植過程中的免疫問題至關重要。關于免疫學的基礎知識已經有多部相關專著詳細闡述，本章內容主要涉及HLA、自然殺傷（NK）細胞同種反應性、T細胞對同種抗原的識別和免疫耐受誘導以及供者特異性HLA抗體在移植排斥中的作用等移植免疫學相關內容及其在allo-HSCT治療惡性血液病中的應用。