會議室里，碇司令和幾個SEELE的成員討論著初號機獲得S2機關的問題。EVA不可能天生就擁有S2機關，seele的成員們也沒想到初號機會以這種方式讓自己獲得S2機關。

由于初號機擁有了S2機關，與seele原本的計劃相差太遠，想要矯正過來并不容易。有人認為把NERV交給碇源堂是一個錯誤，但是沒有碇源堂seele的計劃就無法進行。

白（桌子發光的顏色）：碇，你到底在想什么啊。

碇真嗣困在初號機里的第1天

上次跟力天使的戰斗后，二號機和零號機都嚴重受損，恢復需要很長一段時間。NER內部建造也一樣，幾乎每個樓層都有損傷，但是好在MAGI系統和各個電腦數據都能移植，但是現在這里的NERV總部已經沒有任何可用的了，下令廢棄也只是時間的問題。無奈，全體成員只好移動到備用的第2指揮部了。就算沒有MAGI也要使用。

但第2指揮部也不是跟另一個指揮部一樣，缺點還是有很多的。例如椅子比之前的要小，系統反應器十分緩慢。即使構造和之前的一模一樣，但也只是表面。不過現在這種情況下能用就已經非常不錯了。但初號機還能不能用就不知道了。

另一邊，seele還在討論著初號機的問題，而且還有其他EVA的問題。二號機，零號機，兩臺機體無法使用，四號機的駕駛員應為其他原因在使徒來襲的那天提前回國，地下都市被毀滅了一半以上，中央教條也裸露在外，損失無法估計。為此將會付出不知對少財力和物力。

事情發展成這樣是在意料之外，加持問碇司令要怎樣想seele交代。

冬月：初號機本就不受我們控制，這次是意外事故。

碇司令：對此，初號機決定暫時凍結。

加持：很好的解釋，但是您兒子被困在里面沒問題嗎？

另一邊，眾人為救出真嗣不斷的努力著，但初號機不接受插入栓彈出的信號，強制彈出也以失敗告終。最后也只是聯通了插入栓內部的影像，轉接到主屏幕后全部人都驚了。

插入栓內部只有一套作戰服，而且還是坐在上面的姿勢，像有人在穿著，但卻看不到人。這便是同步率超過400%的真面目，所有真嗣是被初號機給吞噬了。美里詢問EVA到底是什么，而赤木的回答只有一句“我只能說這是人類創造的”

美里：人類創造的？它不是當時在南極找到的那個東西的復制品嗎？少唬我了！

赤木：它和復制品不一樣，它體內被灌輸了人的意志。

美里：也就是說因為有人的意志才導致真嗣現在這樣嗎。

赤木：倒不如說是EVA的意志。

美里：什么嘛！那不是你制造的嗎！你得負責到底啊！

第2天

麗從病床上醒來，但是身上沒有一點傷痕，明日香得知后也前去看望。但是過了一會后，明日香感覺不對，麗比以前要冷漠許多，雖然以前也沒有跟麗有太多的相處，但也不會像跟陌生人說話一樣的冷漠。

第3天

經過NERV上層領導的討論后制定了《營救真嗣計劃》。

插入栓內部仍有真嗣的生命跡象，根據計算，真嗣的身體失去了維持肉體的能力，但是卻能以量子形式維持外表，但是無法用肉眼觀測，簡單來說就是身體隱形了，無法正常的看見。

而插入栓內的LCL發生了化學變化，酷似地球原始海洋，也就是生命之源。構成真嗣的物質全部都保存在插入栓內，可以說類似靈魂的東西也在里面。

計劃用現代科技實體化，并讓其精神安定下來，而且還有MAGI的支持，理論上是可以做到的。

第4天

在一個空白的空間內，真嗣醒了過來，望了望四周，除了一片空白外，一個人都沒有。真嗣開始四處走動，再怎么走都是一片空白。真嗣開始懷疑起來。

真嗣：我，這是，死了？

這時，原本空白的四周，開始有了畫面，是真嗣這一生經歷過的畫面，有快樂的，憤怒的，頑強的，等等。有在來這里之前的，也有來到這里之后的。

真嗣：這是？走馬燈？

（走馬燈在日本傳統中，指人死后看到自己生前的一切記憶，而記憶出現的方式是不斷閃爍著）

真嗣：我該不會真的死了吧？

突然，有一個陌生的畫面閃過，是EVA！但是真嗣是來NERV后才知道EVA的，而那時是在來NERV之前的，這讓真嗣百思不得其解。

第29天

真嗣再次在那空間里醒來。

真嗣：嗯~（伸懶腰），好了，繼續看看這走馬燈吧，說不定還有點線索能出去呢。

真嗣看著自己以前的回憶，剛開始沒有什么，隨后的回憶讓真嗣大吃一驚。

過去，真嗣來的第三新東京市前，曾經自己所讀的學校發生過恐怖分子的襲擊。整個學校都在大火之中，真嗣在教室里昏倒在地，睜開眼睛時，隱約的看見兩個人。雖然兩個人遮住了臉，但還是可以分清楚是一男一女。真嗣不禁想起巧和黑衣女。

那兩人將所有的恐怖分子都殺了后，把他們的身體扔到大火中燒毀。身上的衣服都沾滿了鮮血。

真嗣隱約的聽見他們的對話中，確定了兩人的確是他倆，他們慢慢的露出了臉。臉部露出后真嗣一看，露出驚訝的表情。

巧的頭發雖是白色，臉上有疤痕，但樣貌卻和真嗣一模一樣，而黑衣女的樣貌也跟明日香一模一樣。在他們的模糊的談論中聽到黑衣女叫藍格雷。

這時，巧發現躺在地上的真嗣沒有完全昏倒，便走到面前蹲下。

巧：原來你醒著啊，哦，真是的，胸口居然被那群恐怖分子弄了個這么大的疤，沒關系，我已經都幫你殺掉了。

藍格雷：好了，在不快點的話消防員就要來了。

巧：知道了啦，雖然不知道你能不能駕駛EVA，但出于保險，還是把你的記憶封存起來好了，隨便讓我給你能夠100%啟動EVA的力量吧。

巧將一只手放到真嗣胸口上，瞬間，胸口上的傷完全愈合，只剩下疤痕，真嗣也再次暈倒。

第30天

現初號機內部的LCL溫度維持在36.1，氧氣密度沒有問題，各項裝置無異常。

另一邊，赤木和伊吹在實驗室內不斷工作著，營救計劃也到了收尾工作。但在短短的一個月了就能將營救計劃編輯好，也不太可能。伊吹問到。

赤木說這個計劃是早在十幾年前就編輯好的了，也就說明在EVA的開發過程也發生過類似的事情。赤木對此也不了解，因為那時還沒有在NERV工作，知道這是她媽媽留下的數據。但在最后那次營救計劃是失敗了的。

第31天

真嗣醒來，但是周圍發生了改變，原先空白的空間變成了黑暗的空間。一種陰森感撲面而來，真嗣向前看去，和空白的空間一樣，沒有盡頭。真嗣坐下來了。

真嗣：誒？今天沒有走馬燈了嗎？真是的啊，在這黑暗的空間了什么都做不了，好無聊啊！

外面，《營救真嗣計劃》正式開始了。

發出第1信號，初號機暫無拒絕信號，接著發出第2第3信號，精神狀態無異常。

本以為一切都會平安順利，突然，真嗣的自我境界脈變形，計劃無法實施。

赤木：快，嘗試全方位照射所有頻域。

伊吹：不行，發出信號都被困在幾何空間里了。

美里：什么意思？

赤木：也就是說，我們，失敗了。

系統發出警報，計劃失敗，中止干涉，許多漏洞出現，警報不停的響著。

最后插入栓被強制拉出，LCL的自我防御系統分解，內部氣壓不斷上升，插入栓艙門被打開。

LCL不斷流下，可真嗣卻沒有出來，只留下了一灘LCL，美里跪在地上，不斷拍打著地上的LCL，大喊著“把真嗣，把真嗣還回來！”

眾人以為一切都沒辦法挽回時，初號機的核心射出一道光，擊中旁邊的墻壁后形成了一面墻。而這面墻跟巧的一模一樣，都是時空壁。

真嗣從里面走了出來，一臉迷惑的看著跪在地上的美里，在場的所有人都被驚到了。

美里上前抱著真嗣痛哭。嘴里說道“太好了，真嗣，回來了”

頓時，所有人都開心極了，雖然不知道真嗣怎么出來的，但只要真嗣還活著就好了。

夜晚，真嗣一個人在床上躺著，摸了摸胸口上的疤。

真嗣：原來我的一切都是拜他所賜啊，如果沒有他，我大概就是個無法駕駛EVA的普通人吧。

這時門開了，明日香進來了。

明日香：真嗣，你在嗎？

真嗣從床上做起。

真嗣：明日香，有事嗎？

明日香：不，我也只是，擔心你。

真嗣：怎么會，我可是強的一批。

明日香：你沒事就好。

真嗣：對了，綾波怎么樣了？

明日香：她也沒事，現在已經好多了。

真嗣：這樣啊，那我也放心了，所有人都沒事，這是幸運吶~（伸懶腰）

明日香：也不早了，我不打擾你休息了。

明日香回了房間，真嗣回想起在分離初號機前那之前的事。

真嗣望著四周，一片漆黑，以為自己出不去了，但是突然想起巧一句話

“我即是你，你，即是我”

真嗣：難道我和他是同一個人？也就是說，我應該也有時空壁的吧？反正在這也沒事，試試看。

真嗣用盡一切辦法，都沒發召喚時空壁，躺在地上，嘴里喃喃碎語的說道“難道沒有這道傷疤我就是個廢物嗎？不行，我不能這么放棄，被困在這鬼地方這么久，外面一定有人在等我，我一定要出去！我！要出去！”

真嗣站了起來，用盡全力召喚時空壁，瞳孔有一瞬變成紅色。最后，時空壁成功被召喚出來，此時在真嗣眼前那熟悉又不熟悉的時空壁，便是自己突破人類極限所召喚出來的。

幾天后，真嗣在檢測身體結果出來時很奇怪，據對比，真嗣從初號機內出來后和之前的身體數據相比，前者的數據比后者要高上許多，簡直可以說是超越了人類的身體。并且這種身體還和at立場產生共鳴，加強了at立場的防御能力。

實驗室內，空曠的模擬戰斗場地上，真嗣開啟EVA裝甲站在中間，模擬出的敵人從使徒變成了人類。模擬體向真嗣開槍，裝甲的at立場比原先的立場能力要強上許多。

戰斗結束，數據也一一出來，真嗣的身體數據已經高達不需要EVA裝甲也能有完全超越人類的體質，當赤木尋問真嗣為什么會變成這樣時，真嗣選擇沉默，只回答了一句“不知道”

真嗣離開實驗室，一人在更衣室內坐著，看著一旁鏡子里的自己，注視著自己那時不時變紅的眼睛。

第七章第一集-完

預告：下集，真嗣他們和巧一行人發生沖突，雙方再次展開戰斗。

第七章第二集-對決