失去過去 5 年記憶的青年源劍一在 2051 年的月目市過著平靜的生活，而這平靜生活卻突然被一種名為“異生人”的怪物打破。

按照未來人的預言，他會在未來某一天，異生人為人類帶來毀滅之時成為人類的救主，但終究不敵并被殺死。而未來人竊用異生人的時間技術將源劍一未來的武器，驅動器Deep Cyclone送回更早的過去，以期他能夠阻止世界末日的到來。

為了保護更多人免于異生人的侵擾，他最終決定成為假面騎士 Fize，接受并改變自己與人類的未來。