《內經》對咳嗽的成因、癥狀及證候分類、證候轉歸及治療等問題已作了較系統的論述，闡述了氣候變化、六氣影響及肺可以致咳嗽，并出現了討論咳嗽的專篇——《素問·咳論》。①從成因來說，《內經》指出了內、外兩個方面。外因主要是外感風寒，由皮毛而入，合于肺而為病。《素問·咳論》中云：“皮毛者，肺之合也，皮毛先受邪氣，邪氣以從其合也”。而風、寒、暑、濕、燥、火六氣勝負的變化對咳嗽也有影響。《素問·陰陽應象大論》云：“秋傷于濕，冬生咳嗽”。秋天本是涼燥的季節，如果感受了濕氣，至冬天寒冷之時必會表現為咳嗽的癥狀。《素問·氣交變大論》云：“歲火太過，炎暑流行，金肺受邪，民病瘧少氣咳喘”。夏季暑熱太過，灼傷肺金，則百姓易患瘧疾咳喘等熱病。《素問·至真要大論》：“少陽司天，火淫所勝，則溫氣流行，金政不平，民病頭痛……瘡瘍、咳”，“陽明司天，燥淫所勝……民病……咳”。說明當時已十分重視咳嗽與氣候變化的關系。②從內因來看，寒飲入胃，則冷飲之邪，循胃口上膈，從肺系上干肺而致咳。從臨床表現及證候證候分類來說《素問·咳論》詳細論述了五臟咳與六腑咳的癥狀。③從病理轉歸來看，《內經》首先認為咳嗽是肺的病變，如《素問·宣明五氣》說：“五氣所病……肺為咳。”《靈樞·經脈》又說：“肺手太陰之脈……是動則病肺脹滿，膨膨而喘咳……是主肺所生病者，咳上氣喘……”。但《素問·咳論》作為一篇論述咳嗽的專篇，指出“五臟六腑皆令人咳，非獨肺也。”說明其他臟腑受邪，皆可影響于肺，而發生咳嗽。其傳變規律是，五臟之咳，日久不愈則傳于六腑，從臟腑表里關系相傳。而五臟六腑之咳“皆聚于胃，關于肺”，認為胃為五臟六腑之海，而肺主氣為百脈之朝會，故臟腑受邪，必聚于胃，并循肺脈而影響于肺。強調了肺臟受邪以及臟腑功能失調均能導致咳嗽的發生。對咳嗽的癥狀按臟腑進行分類，分為肺咳、心咳、胃咳、膀胱咳等，并指出了證候轉歸和治療原則。④從治療來說，則提出五臟之咳，應取腧穴，六腑之咳，應取合穴，有浮腫者，可取臟腑之穴而分治之。《內經》的論述，為后世對咳嗽的研究，奠定了理論基礎。

漢·張仲景所著的《傷寒論》、《金匱要略》，對咳嗽證治作了許多具體的論述。如《傷寒論》治療傷寒表不解，心下有水氣，干嘔發熱而咳的小青龍湯。《金匱要略·肺痿肺癰咳嗽上氣病脈證治》治表邪夾寒飲咳喘氣逆的射干麻黃湯，治寒飲內停的苓甘五味姜辛湯，治虛火咳逆的麥門冬湯等，均為后世沿用治療咳嗽的著名方劑。《金匱要略》和《傷寒論》不僅擬出了治療咳嗽行之有效的方劑，還體現了對咳嗽進行辨證論治的思想。

隋·巢元方《諸病源候論·咳嗽候》在《內經》五臟六腑皆令人咳的基礎上，又把咳嗽分為“風咳”、“寒咳”、“支咳”、“肝咳”、“心咳”、“脾咳”、“腎咳”、“膽咳”、“厥陰咳”等十種咳嗽病，并對這十種咳嗽做了癥狀的描述和鑒別，如“一曰風咳，欲語因咳，言不得寬是也，二曰寒咳，飲冷食寒，入注胃，從肺脈上氣，內外合，因之而咳是也”等，對后世有較大影響。

唐宋時期，唐代孫思邈《備急千金要方》，王燾《外臺秘要》，宋代《太平圣惠方》、《太平惠民和劑局方》等收集了許多治療咳嗽的方劑。宋·陳無擇《三因極一病證方論》將咳嗽分為內因、外因、不內外因所致的三類。至金·劉完素、張子和更明確地把咳嗽與六氣聯系起來，提出“風、寒、暑、濕、燥、火皆令人咳”及“嗽分六氣，無拘以寒說”，進一步闡明咳嗽與自然界“六淫”的關系，而劉完素及李東垣尤重視濕邪的致病因素。王好古《此事難知》專門論述了“秋傷于濕，冬必咳嗽論”、“濕氣所傷論”，闡發“秋傷于濕，冬生咳嗽”（《素問·陰陽應象大論》）、“秋傷于濕，上逆而咳”（《素問·生氣通天論》）的經義。《丹溪心法·咳嗽》則將咳嗽分為風寒、痰飲、火郁、勞嗽、肺脹五種。

自隋唐以后，金元四大家對于咳嗽的病機分析及辨證治療做出了不同的貢獻。如劉河間《素問病機氣宜保命集·咳嗽論》說：“咳謂無痰而有聲，肺氣傷而不清也；嗽是無聲而有痰，脾濕動而為痰也；咳嗽謂有痰而有聲，蓋因傷于肺氣，動于脾濕，咳而為嗽也。”指出了咳嗽與肺氣、脾濕的關系。《素問病機氣宜保命集·咳嗽論》謂：“寒、暑、濕、燥、風、火六氣，皆令人咳嗽”。張子和《儒門事親·嗽分六其毋拘以寒述》則對風、寒、暑、濕、燥、火六種咳嗽分別制定了相應方劑，并提出：“老幼強弱，虛實肥瘦不同，臨時審定權衡可也。病有變態，而吾之方亦與之俱變”的論點。如謂“上半日多嗽者，此屬胃中有火，用貝母、石膏降胃火。午后嗽者，多屬陰虛，必用四物湯加炒黃柏、知母降火”等，為咳嗽辨證論治提供了新的內容。

明代醫家對咳嗽的辨證論治更有新的補充。王綸《明醫雜著·論咳嗽證治》指出“治法須分新久虛實，新病風寒則散之，火熱則清之，濕熱則瀉之，久病便屬虛、屬郁，氣虛則補氣，血虛則補血，兼郁則開郁，滋之、潤之、斂之則治虛之法也。”強調治咳須分六淫七情及五臟相勝，脾肺虛實。李梴《醫學入門》首先出現外感、內傷分類，為后世對咳嗽的分類提供了借鑒。對內傷咳嗽中的火咳、郁咳、五勞虛咳及瘀血內阻等癥的治療，進行了比較詳細的論述。同時，在此時期結合臟腑生理功能并從其相互關系研究了咳嗽的病機。如王肯堂《證治準繩·雜病·咳嗽》引《仁齋直指方》“肺出氣也，腎納氣也，肺為氣之主，腎為氣之本”之說，闡發了肺腎對氣的相互關系，為腎虛咳嗽治療提供了理論依據。趙獻可《醫貫》進一步論述咳嗽與肺、脾、腎三臟的關系，并強調腎的重要，對于火爍肺金之咳，力斥寒涼之弊，力主用六味丸壯水制陽，認為“滋其陰即可以降火，補北方正所以瀉南方”，對后世醫家多有啟發。《景岳全書·咳嗽》對外感、內傷咳嗽的病因、病機、證候、治療，論述頗詳，說：“外感之嗽，必因風寒”，“咳證雖多，無非肺病”。提出外感咳嗽由肺而及他臟，故以肺為本，他臟為標；而內傷咳嗽則由他臟及肺，故以他臟為本，肺為標的見解。這對后世治療咳嗽起了很大的指導作用。張氏還對外感內傷咳嗽的辨證提出了若干要點，在治療上則提出外感咳嗽以寒邪為主，治以辛溫，但須根據不同歲氣施治，而在“時氣”與“病氣”的關系上，又當以病氣為主。內傷咳嗽以陰虛為主，治以滋陰，但見虛寒而咳嗽不已者，又當補陽。這些論述，都從不同方面大大豐富了辨證論治的內容。李中梓《醫宗必讀·咳嗽》在申明咳嗽“總其綱領，不過內傷外感而已”的前提下，對外感內傷的治療原則，提出了自己的見解，指出“大抵治表者，藥不宜靜，靜則留連不解，變生他病，故忌寒涼收斂，如‘五臟生成’篇所謂‘肺欲辛’是也。”一直為醫家所重視。

喻昌《醫門法律》對于燥的病機及其傷肺為病而致的咳嗽的證治，多有發揮，并提出《內經》“秋傷于濕，冬生咳嗽”當為秋傷于燥的見解，還對內傷咳提出“內傷之咳，治各不同，火盛壯水，金虛崇土，郁甚疏肝，氣逆理肺，食積和中，房勞補下，用熱遠熱，用寒遠寒，內以先傷，藥不宜峻”等治療法則，并針對治療新久咳嗽常見問題，提出六個條律，示人不可違反，防止醫源性錯誤的發生，頗助臨床參考。

清代·沈金鰲《雜病源流犀燭》在論述咳嗽的病理時說：“蓋肺不傷不咳，脾不傷不久咳，腎不傷火不熾，咳不甚，其大較也”。僅指出肺脾腎三臟是咳嗽的主要病變所在，并指出了咳嗽累及的臟腑是隨著病情的加重，由肺及脾，由脾及腎的。葉天士《臨證指南醫案·咳嗽》指出：“若因于風者，辛平解之。因于寒者，辛溫散之。因于暑者，為熏蒸之氣，清肅必傷，當予微辛微涼，苦降淡滲……若因于濕者，有兼風、兼寒、兼熱之不同，大抵以理肺治胃為主。若因秋燥，則嘉言喻氏之議最精。若因于火者，即溫熱之邪，亦以甘寒為主……至于內因為病，不可不逐一分之。有剛亢之威，木叩而金鳴者，當清金制木，佐以柔肝入絡。若土虛而不生金，真氣無所稟攝者，有甘涼、甘溫二法，合乎陰土陽土以配剛柔為用也。又因水虛痰泛，元海竭而諸氣上沖者，則有金水雙收，陰陽并補之治，或大劑滋填鎮攝，保固先天一氣元精”。這些論述，堪為治療咳嗽的基本病律，至今對臨床仍有參考價值，總之，由隋唐至明清，對咳嗽的分類、病機、治療原則、方藥等均有了廣泛而深入的研究，使有關理論及實踐經驗不斷得到充實。