黑暗中的根部，團藏醞釀著新一輪的陰謀。

團藏在得知宇智波帶土的情報之后，就思考著打擊水門威望的計劃。經過大蛇丸的人體改造之后，他的身體重新恢復了活力，實力有了極大的增強。他的野心從來都沒有改變，在他看來，只要不斷打擊水門的威望，自己就有希望登上火影的位置。

憑借著和曉組織的聯系，消滅忠誠于水門，三代的忍者，讓他們相互消耗，到最后一舉挫敗曉組織的陰謀，然后順其自然的成為火影。這就是他的計...