安托涅瓦，中央庭的創始人之一，溫柔而堅強的大姐姐。
原本是文學系研究生，在異變發生的時候目睹親人慘死在黑霧中，她的身體發生異化，成為第一批神器使。
擅長文字、記錄相關的工作，做事巨細無遺，自中央庭建立以來就一直擔當繁重的文書工作。
看起來非常溫和好相處，會開玩笑，也會在恰當的時候認真嚴肅，很容易和人打成一片。
是個能夠為了自己的理念，忍受任何痛苦的堅強女性。
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活骸化是不可逆的，這是已知道的既定事實。
安托涅瓦身上的活骸愈發加重，距離真正活骸化已經不剩多少時間。
但，一定會有恢復的辦法，就算是奇跡也一定要去找出來！
——方舟建造完成之后。
指揮使開始進入方舟尋找拯救安托涅瓦的“奇跡”。
第一次方舟穿梭：
指揮使來到別的平行世界之后，正巧在偏僻的郊區街道上，遇到一輛好心停下讓指揮使搭車的破舊二手車。
司機卻是年輕健全的十八歲少女——安托涅瓦。指揮使搭乘上安托涅瓦的順風車，并得知學生時代的少女家境清寒仍在努力打工堅持著學業。
更是得知年輕時的安托涅瓦最大的愿望是駕車環游世界并參觀世界所有圖書館，懷著那樣美好愿望的少女。
但因方舟時間有限，指揮使沒能說出來找安托涅瓦的目的。
于是被方舟強制返回。
第二次方舟穿梭：
就如同安托涅瓦說過的那樣，穿越到哪個世界哪個時間點都是隨機的，在千粒萬粒的時光中尋找正確的沙礫……就是我要做的事情。
指揮使第二次來的地方是一座學校。并且遇上最初的黑門事件。
當然這是另一個時空之中，這個世界的安托涅瓦并不認識指揮使。
依舊是學生模樣的安托涅瓦，此時還是個普通人，但她卻是自強與勇敢，為了保護學院之中被怪物圍困的同學，獨自一人正面與黑門怪物斗智斗勇。
但被怪物圍困，那都是別人作死，可安托涅瓦卻還是義無反顧的去救他們。
指揮使：“夠了，不要去管那些作死的人了。你只是普通的人而已！為什么非要去肩負起其他人的命運！你是圣母嗎！”
年輕的安托涅瓦：“才不是呢！……我只是很害怕一個人。與其一人孤獨的生活，我更希望除我以外的其他人能更好活著。”
最后安托涅瓦為了保護別人，仍是義無反顧的獨自去與黑門怪物戰斗。
但，她周圍的空間開始浮現零星的扭曲，虛空紛紛破碎成片，一名新的神器使誕生了。
只是，指揮使的時間又到了，再度被方舟強制送回。
相對的，又更加了解了安托涅瓦的想法。為了不想孤單一人，寧可犧牲自己也要讓別人活下來……安托涅瓦也是因此，才寧愿犧牲自己，希望更多人活下去吧。
但那樣做真的能夠讓大家變得幸福嗎……安托涅瓦……？
第三次方舟穿梭：
這一次指揮使來到的是中央庭剛剛成立的時候。
同樣正巧遇到已經是中央庭管理者的安托涅瓦，當然，安托涅瓦依舊不認識指揮使。
每次時空穿梭遇到的，都是不同的安托涅瓦。
而指揮使只是輕微透露說是來尋找某件東西。
不過，這一次，指揮使在安托涅瓦身邊遇到了一位從沒見過的神器使，小女孩名為——零。
遇見那叫“零”的少女之后，空間產生了劇烈波動，飛快分崩離解。
這次方舟穿越的時間比平時更短。指揮使再度被方舟強制送回。
不過，安托涅瓦卻是驚訝察覺到了指揮使離去的方舟力量。
或許是猜出指揮使是來自另一個時空的人。
對于那名神器使“零”，指揮使決定前往中央庭尋找資料……
三次方舟旅行暫時結束。
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與此同時……
這里是，希羅多個據點的其中一個。
男人步伐略有些沉地，不斷來回走著。
一點點焦躁，不過真的只是一點點而已。
希羅：“所以……你就這么回來了？”
安：“……非常抱歉，沒能完成任務。”
希羅：“啊啊，你真是讓我失望啊。”
希羅：“我可是聽說安托涅瓦安然無恙，隨時都會醒過來。”
希羅：“她醒來后把事情說出去的話，會發生怎樣的事呢？”
安：“……！”
安：“我會再去一次的，請再給我一次機會。”
希羅：“安托涅瓦的退場原本就是在我的計劃中，這一出意外本來是很合適我的心思。”
希羅：“可看你的眼睛就明白了，你仍然在動搖。”
安：“不是的，我只是不太理解這一切的原因……”
希羅：“呵呵，你們相處了才那么短時間，就被影響了不少啊。我可不記得給你設置過懷疑的指令。”
安：“非常抱歉……”
安生怕希羅反悔。她的身影迅速消失在黑暗中。
最后只剩下希羅露出愉悅的笑容。
希羅：“有趣。真的非常有趣啊。”
希羅：“墜入愛河的少女的不幸，簡直沒有比這更美妙的東西了。你覺得如何啊？”
希羅話音剛落，黑暗中飛出一只蝙蝠模樣的黑色魔偶。
魔偶在半空中上下飛舞著，發出少女般的清麗聲音。
“你明知道那是陷阱還讓她回去？真是壞心的主人。”
希羅：“賣個人情而已，而且說不定能成功。”
希羅：“對了，之前的戰斗記錄，也是你給安托涅瓦的吧？說我壞心，你也差不多吧。”
魔偶：“很有趣吧~我可是無聊了很久才終于——找到機會。”
……
安走在中央庭空曠的走廊中。
自那天中央庭分裂之后，中央庭的人就變得很少了。
機械電子音：前方特殊病房，進入需要驗證身份……
身份驗證完畢，進入病房。
終于又見到了安托涅瓦……
活骸化進化到一半的模樣，黑色紋路爬滿全身。
安走到病床邊，靜靜地注視著安托涅瓦。
安：“對不起……但這是我的選擇。而且……我實在理解不了。”
安：“犧牲自己讓世界恢復原樣？”
安：“沒有小孤，沒有大家的世界，恢復了又有什么意義。”
安：“你醒來之后一定會讓小孤犧牲自己凈化黑核……他也一定……會接受這一切吧。”
安：“但是那樣就太奇怪了！犧牲的意義……這一切的意義，我完全不明白。”
安：“我只是想和大家在一起，一直，永遠在一起。”
安：“所以，如果有人要破壞這一切……”
安對著安托涅瓦召喚出了武器。
這時。
指揮使：“住手啊！安！”
安：“！！你怎么會在這里！”
指揮使：“為什么……為什么真的是你？”
指揮使：“到底是……為什么……”
然而——絲毫不理會我的質問，安只是不斷的搖著頭。飛快地逃走了。
（小孤選擇留下照顧安托涅瓦，并聯系晏華去關注安的行蹤）
“咳咳……”
指揮使：“安托涅瓦！！”
安托涅瓦：“安說的我都聽到了。其實她說得很有道理呢……”
安托涅瓦：“……希羅說的是實話。”
安托涅瓦：“你再繼續凈化黑門之核的話，終有一天會耗盡生命幻力死去。”
安托涅瓦：“黑門關閉之后，神器使也將一個個死去。”
安托涅瓦：“但……如果不這么做的話，黑門就無法關閉，世界也無法恢復正常。”
安托涅瓦：“如果將世界上千千萬萬人，和僅存此地的幾十名神器使同時衡量，我會毫不猶豫的選擇前者。”
安托涅瓦：“將人的生命以單純的數量來衡量……這樣的我，其實和希羅并沒有兩樣……”
安托涅瓦：“希羅說的沒錯，我是個……不會愛上任何人，也完全不會愛自己，無情無義又沒有人性的家伙呢……”
指揮使：“才不是。我知道你才不是那樣的人。”
指揮使：“堅定努力的想要環球旅游世界；在災禍到來之時指揮撐起一切，為所有人尋找逃出去的方法；會開車，上路很穩，在雙腿健康的時候，是個跑起來沒有怪物能追上你的健將。”
“坦然地說出自己是懼怕孤獨的膽小鬼，于是在天平上選擇更多人的那一方，就算自己是被舍棄的那部分也毫不猶豫。”
指揮使：“堅定堅強到如此的女性……這就是我們所喜歡的你啊。”
“……你怎么……你怎么會知道這些……這么丟臉的事情……”羞紅的安托涅瓦，虛幻得像隨時都會消逝一樣。
指揮使：“我絕不會放棄，也不會離開。請你一定要相信我。”
安托涅瓦：“……好呀，我相信你……拜托了……讓我能夠回去……”
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三次方舟結束后。病房探望結束后。
繼續查找關于神器使“零”的資料。
從晏華口中得知，零便是第一個成為活骸的神器使，正是導致半年前活骸事件發生的活骸零。
那次安托涅瓦為了阻止零，導致自身力盡瀕死，最后是將零的活骸化心臟“不死結晶”取出，救了安托涅瓦，雖然安托涅瓦存活了下來，但也是自那之后失去了雙腿的知覺。
指揮使得知這些情報之后，開始了最后一次的方舟穿梭。
最終回到過去——正是零活骸化的時間點。
穿越時空而來的指揮使，正巧碰上正在與活骸零戰斗的安托涅瓦。
活骸零的強大并不是安托涅瓦一人能正面抗衡，面對一意孤行對抗活骸的安托涅瓦，指揮使抓起安托涅瓦的手，轉身狂奔。
不過，這次安托涅瓦卻是認出了指揮使。最后指揮使對安托涅瓦說出了穿越空間來到這里的目的，需要“不死結晶”，最后還是留下與活骸零進行戰斗。
最終在指揮使的幻力支援下，安托涅瓦打敗了零，而指揮使也帶著不死結晶返回原本的世界。
而擊敗活骸零的戰場上，在眾人離開之后……
不知何時，雨下了起來。
細碎的，染著黑色霧氣的雨滴從天空中落下來。
就像是誰在哭泣一樣。
戰斗結束的殘骸上，出現了一名打著傘的男人。
希羅：“你做到了……但為什么，偏偏是你做到了……”
希羅：“【零】啊……”
……
雷切爾得知不死結晶的事情后，主動提出來進行分析。
最終分析成功。
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中央庭的病房內。
為了救回安托涅瓦，已經做了各種的努力，希望這一切，都能有個好的結果……
看著已經經過不死結晶治療過后的安托涅瓦，已經不知道還能做什么，一直靜靜在床邊守護著安托涅瓦。
唔……好困……一旦停下來，疲勞就全部涌上來了……
在第二天的清晨。
安托涅瓦大病初愈的在病床上蘇醒：“真是個……笨蛋呢。”
床邊的指揮使醒來：“唔……誒。安托涅瓦……”
安托涅瓦：“早安。小孤。”
指揮使：“唉，我居然睡著了。你感覺怎么樣？還有晶體殘留嗎？”
安托涅瓦：“好到似乎可以去找雯梓喝一杯了……”
安托涅瓦：“非常可靠呢，小孤。稍微有些可靠過頭了也說不定呢。”
指揮使：“說、說什么呢……這不是應該的嗎！要是沒有了安托涅瓦……我們……”
安托涅瓦：“你啊，為什么要這么拼命的來救我呢？……來，重說一次，沒有了我……然后呢？”
指揮使：“沒有了安托涅瓦……我們就……”
安托涅瓦：“不——對。重來。”
指揮使：“誒！……我們……”
安托涅瓦：“還是不對，再來。”
指揮使：“到、到底要怎么……”
安托涅瓦：“果然還是不能期待有多坦率嗎。”
指揮使：“我……”
安托涅瓦蘇醒之后，調皮地調戲指揮使后，然后起身輕輕靠近了指揮使……
一股柔軟溫暖的觸感貼在了指揮使的嘴唇之上，令得人的內心小鹿亂撞。
啾。柔然的。像是櫻花一樣的吻——安托涅瓦的感謝。
慌張的指揮使：“我我我我……”
安托涅瓦微微一笑：“呵呵，獎勵結束。”
安托涅瓦：“昨晚到現在都沒有休息吧。回去收拾一下，準備開始新的一天吧。”
安托涅瓦：“在床上躺了那么久，再不活動一下，大腦都要變得遲鈍了。”
安托涅瓦：“我也要準備新的戰斗了。你就等著瞧吧。”
指揮使：“雖然不知道是什么……但是只要安托涅瓦就一定沒問題！”
中央庭一定能夠阻止希羅，阻止黑門。
之后，安托涅瓦舉行了中央庭的正式發布會……有關之前的分裂內容、后續人力安排、對希羅放出的諸多謠言一一進行解釋。
自信的身影。
高層會議上，安托涅瓦一人擋住了臺下眾人咄咄逼人的追問。那身影仿佛會放光一樣，非常耀眼。
中央庭就此全面與希羅宣戰，阻止希羅的野心……
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以上稍微根據游戲原文案照搬。
安托涅瓦線到此結束。
每條線都是過渡的粗略講講重要劇情。