準格爾翼龍是最早在我國發現的翼龍，眼發達，喙嘴鋒利、尖端上翻，牙齒小而堅硬，垂直冠飾明顯，而其骨骼中空輕盈，背部脊椎連在一起形成聯合背椎，這種身體結構很適合飛行。