原定于萬歷四十七年三月二十一日出師，但是因?yàn)榇艘鬯姆秸{(diào)兵，使遼東軍餉驟增三百萬兩銀錢，朝廷上下皆認(rèn)為是此役是一場速戰(zhàn)速決，十日內(nèi)便能打敗后金，加上當(dāng)時(shí)朝廷財(cái)政狀況不佳，戰(zhàn)爭是一個(gè)沉重的負(fù)擔(dān)，所以不敢冒著破產(chǎn)的風(fēng)險(xiǎn)。
雖說內(nèi)帑里有著眾多儲銀，但皇帝怎么也不肯撥出來應(yīng)急于遼東戰(zhàn)事。
于是內(nèi)閣大學(xué)士方從哲、兵部尚書黃嘉善、兵科給事中趙興邦等廷臣唯恐師老餉匱，不斷發(fā)出兵部紅色令旗，督促楊鎬盡快出兵。
于是楊鎬決定提前于二月二十一日出征。但因天降大雪，行軍困難。
馬林向楊鎬勸諫“王師當(dāng)出萬全，宜并兵一路，鼓行而前，執(zhí)取罪人，傾其巢穴。”
劉綎則提出地形未諳、大雪迷路，應(yīng)推后進(jìn)軍的日期，同時(shí)也對軍隊(duì)的戰(zhàn)力質(zhì)疑，并且要求調(diào)集其手下川軍三萬，可惜兵部只準(zhǔn)許調(diào)集五千川軍。
杜松亦認(rèn)為朝廷兵餉不足，士卒久未訓(xùn)練，各營彼此又不熟悉，將領(lǐng)之間的關(guān)系也不協(xié)調(diào)，根本就未能大規(guī)模興兵。
但是楊鎬皆置之不理，最后決定于二月二十五日出師，在遼陽教場斬?fù)犴樚訉自讫堊骷榔臁Ｈ姽彩嗳f兵，號稱四十七萬。再加上應(yīng)明朝之約前來助戰(zhàn)的一萬三千名朝鮮兵和葉赫兵一部兩千兵馬。
楊鎬與諸將議定，分四路進(jìn)攻后金，總兵劉綎率軍出寬甸由東；總兵馬林率軍出三岔口由北；杜松率軍出撫順關(guān)由西；李如柏率軍出鴉鶻關(guān)由南，其中以西路杜松為主力，皆直指赫圖阿拉。此外，王紹勛總管各路糧草，楊鎬坐鎮(zhèn)沈陽。
明軍雖說在萬歷年間沒少進(jìn)行實(shí)戰(zhàn)磨練，有些軍士甚至都是軍中一等一的高手。但是整體戰(zhàn)斗力、機(jī)動力和士氣皆在后金軍之下，只有裝備、武器，人數(shù)領(lǐng)先。而且主將無能累死三軍。
楊鎬既不知兵，又無諸葛之才。所以行諸葛之事，必然的結(jié)局就是失敗。
西路軍在主將杜松的帶領(lǐng)下，首先應(yīng)敵與薩爾滸山。努爾哈赤用杜松派兵襲擊界凡之時(shí)，猛攻薩爾滸明軍，明兵潰敗，勇而無謀、剛愎自用的杜松戰(zhàn)死。
接著，努爾哈赤將兵北至尚間崖，擊敗馬林部，馬林逃往開原，葉赫兵倉惶撤退。
這時(shí)，努爾哈赤回師南下，誘敵深入，在阿布達(dá)里，圍殲劉鋌東路軍，劉鋌陣亡，姜弘立所部朝鮮兵投降。
楊鎬聞知三路軍慘敗，急令南路軍李如柏撤回。努爾哈赤用了五天時(shí)間打了一場漂亮的殲滅戰(zhàn)，明軍文武將吏死者三百一十多人，士兵身亡者四萬五千八百余人，亡失馬駝甲仗無數(shù)。
此事傳回京師，朝野震然。主戰(zhàn)的都灰頭土臉的，主和的一個(gè)個(gè)都跳了出來，開始大放闕詞，還口無遮攔的說著不該說的話，他們幸好遇上的不是太祖和成祖二位爺，不然，他們這些人估計(jì)早就被誅族了。
當(dāng)消息傳到京師時(shí)，朱由學(xué)正好在皇帝那邊。自從大軍出發(fā)后，他每日都早早的來到皇帝的寢殿，守著等結(jié)果。
今日，前線一軍士駕馬十萬火急趕到京師報(bào)告前線之事。雖說皇帝有自己的秘線渠道，但這樣的事情，任誰在沒有調(diào)查清楚時(shí)，也不敢往上報(bào)啊。
“陛下，前線戰(zhàn)敗，文武將士死傷無數(shù)。??????”那軍士單跪在地上，沉重的咽聲道。
朱由學(xué)和皇帝聽到這個(gè)消息，心砰的往下一沉。朱由學(xué)端在手中的茶杯都碎落在地。
朱翊鈞不愧是做過幾十年的皇帝，經(jīng)歷過大風(fēng)大浪。“此事可有誤報(bào)，確認(rèn)過沒？”朱翊鈞已經(jīng)接受了這番消息，因?yàn)樗麄冊谶@種事情上沒人敢給他作假，但內(nèi)心還是希望這事假消息。
“回陛下，此事千正萬確，卑職不敢妄言?！?
“你下去吧，好生休息一番?！敝祚粹x柔聲的對著那軍士說道。
“卑職告退”那軍士也不多說話，雙膝下跪磕了頭，就起身離開了。
此時(shí)，朱由學(xué)還是沒有回味過來，他內(nèi)心里可謂是五味雜陳。
“由學(xué)，由學(xué)，由學(xué)??????”朱翊鈞看著還在發(fā)呆的朱由學(xué)叫喚他，連續(xù)三聲他都沒有反應(yīng)過來。
朱由學(xué)突然感覺有人在叫他，驚得下行醒了過來?！盎薁敔敚蓪W(xué)剛才無禮了?！?
“沒事的，朕不怪你。”朱翊鈞這句話說得很是無力，很是傷感，他那年老的雄心被這場失敗給淋得無影無蹤。
朱由學(xué)正準(zhǔn)備張口詢問皇帝，這采用了自己的主張?jiān)趺催€是失敗了。難不成自己也得經(jīng)歷亡國的痛苦。但是，看到皇帝那般摸樣，又不忍心再次在他的傷口上撒鹽。
朱由學(xué)退去殿內(nèi)眾人，就坐在皇帝旁邊的地上，看著皇帝。他心里也在爭斗著。
廷臣們接到戰(zhàn)報(bào)，也都紛紛求見皇帝。朱由學(xué)見皇帝坐在那精神不佳，便到宮門那告訴各位廷臣，讓他們回去。
眾人一見是二皇孫又不是太子，所以他們根本不聽他的話，還是囔著要見皇帝。朱由學(xué)見左右都不能說服他們，不禁有點(diǎn)惱羞成怒。從袖囊中拿出金牌，指著眾人，廷臣們一看是金龍牌，都行了一禮，有幾個(gè)眼尖的，更是嚇得當(dāng)場拔頭就走。不明所以的人，還大罵這幾個(gè)家伙不夠義氣??????
眾臣見過金牌，不再像之前那樣不將朱由學(xué)不放在眼里，現(xiàn)在在和他商量著。可是朱由學(xué)也不是什么省油的燈，他也壓根沒將他們放在眼里，反正自己又不和他們打交道。所以，就直接讓宮門守衛(wèi)關(guān)閉宮門，然后也沒回皇帝那，直接回了寢宮。因?yàn)檫@件事，潛居在慈慶宮的太子朱常洛還不知道。
“什么，你確定？這件事可不是鬧著玩的，弄不好可是要?dú)㈩^的。”太子從座位上蹭的起來，急問道。
“父王，您說我會拿這事開玩笑嗎，而且我是那種人嗎？！”朱由學(xué)立馬給自己辯解道。
“不是的，這不??????父王也是一時(shí)著急。”
“對了，父王，您說啊，上次我向皇爺爺進(jìn)言，并且給他提供的進(jìn)軍方案，而且皇爺爺也同意了。您說，這次的失敗，皇爺爺會不會??????”
朱常洛一聽朱由學(xué)的話，大叫一聲：“什么，這次的方案是你提的？”
朱由學(xué)見朱常洛兩眼通紅，就跟發(fā)怒的獅子似的隨時(shí)都有可能私下你的一塊肉，就點(diǎn)了點(diǎn)頭。
“你??????你，你給我跪下，你個(gè)逆子，這么大的事，怎么也不和我商量下，就擅自做主。”朱常洛說著，就找東西想打朱由學(xué)。
守在外邊的王安，聽到里面的動靜，知道自己沒有資格、能力勸解，就緊忙的跑了出去。
“你個(gè)逆子，我今日打死你算了，省得你到處為害，你個(gè)逆子，??????”太子每說一句，就在朱由學(xué)身上抽打下。朱由學(xué)從頭至尾沒有哼哈一句，任憑太子的打罵，因?yàn)樗F(xiàn)在也怕了。之前被福王派人行刺命懸一線他都沒有害怕過，現(xiàn)在他害怕了，他感覺是自己一手將大明給毀了，一手又將努酋給扶持了起來。
不多會兒，王安帶著乾清宮的皇帝身邊的太監(jiān)來到了慈慶宮，而且還帶來了圣旨。
圣旨大意是說，遼東這件事和朱由學(xué)無關(guān)，而且朱由學(xué)當(dāng)時(shí)建言有功，等等。
當(dāng)年六月，后金打下開原。七月，攻占鐵嶺。從此，努爾哈赤由防御轉(zhuǎn)入進(jìn)攻，明朝在東北地區(qū)的統(tǒng)治開始全面崩潰。
軍政糜爛，各地優(yōu)勢災(zāi)荒不斷。真是雪上又加霜。皇帝再也承受不了了，他倒了，他并不是病倒，而是精力殫盡，身體承受不了。