FreeSurfer是美國MITHealthSciences&Technology和MassachusettsGeneralHospital共同開發的磁共振數據處理軟件。該軟件是一款用于分析腦神經數據的工具集合，它提供了一系列的算法來量化人腦的功能、連接以及結構屬性，能對高分辨率的磁共振圖像進行三維重建，生成展平或脹平圖像，并能得到皮質厚度、面積、灰質容積等解剖參數。本專欄按照逐步深入的邏輯順序開展，第一部分介紹FreeSurfer軟件的安裝、使用方法，并以測量腦皮質厚度為實例“演示”FreeSurfer在頭顱核磁共振圖像的全部分析研究過程。其次，專欄深入分析FreeSurfer的分割、展平等算法。最后，將介紹部分涉及FreeSurfer工具的科研課題。