背景：2386年，人類在全方位建立太陽系基地的時候，在泰坦星附近遭到遭到不明生物攻擊，俄羅斯派出的精英α隊伍瞬間失去聯系，緊接著，運輸3隊的8艘星艦有無緣無故的消失，只有一位飛行員駕駛著幽靈戰機返回，但是，這位飛行員好似精神失常一樣，嘴里不斷地說著一個詞：星靈艦隊……后來，經過縝密的調查，發現對方是一種名叫星靈的高級生物，科技遠遠領先我們500年，地球聯邦派出3隊的戰列巡航艦護送大使的專座去到那里準備談判，可是還沒到地方，艦隊就被一個巨大的黑洞包圍了，巨大的黑洞吸力過大，法拉第艦隊直接被吸了進去，危急時刻，企業號發射了曲速核心，引爆自己，將其余的戰列巡航艦頂出一段距離，隨后，又有8艘星艦發射大和炮引爆自己，將剩下的唯一一艘星艦：麒麟號，加速到4級曲速，才逃離了那里，可是，還沒有回到基地，麒麟號又遭到不明的船只攻擊，他們的武器極為先進，將麒麟號瞬間撕成兩半，只有當時4位在逃生艙檢查的人員僥幸逃離，從此再無音訊。