一顆名為秋起星的星球的天空，突然出現了一道裂縫，而裂縫的另一頭，有著一顆秋起星星人從未見過的S型星星，少女維拉在樹林中發現了一名名叫迭代的少年，之后維拉的父親維克斯發現這位少年竟然是外星生物！從他的口中得知，裂縫似乎跟一百多年前的事件有關，一百多年前，一位修女離奇失蹤，而現場則遺留了很多秋起星人看不懂的符號，然而更巧的是，修女消失之后教會便開始接管達撒大陸，并開始全面抵制和打壓科學……少年為何會降臨到秋起星？裂縫產生的原因是什么？S星上是否有智慧生物？他們是敵是友？一百多年前究竟發生了什么？教會到底有什么隱瞞著眾人？少年與維克修一行人，能否推翻教會？能否探索S星？他們又將會衍生出什么樣的故事？一切都盡在《秋起事變》！