2020年1月23日，湖北武漢城外，“封城”令一出，舉國(guó)嘩然，接著便是展開(kāi)了一場(chǎng)無(wú)硝煙的生死保衛(wèi)戰(zhàn)。英雄院士鐘南山親率一線醫(yī)護(hù)人員經(jīng)過(guò)無(wú)硝煙的廝殺戰(zhàn)，突出重圍，奮力阻擊新冠病毒的蔓延。面對(duì)呼嘯而來(lái)的病毒原體，國(guó)人束手無(wú)策，情急之下，全國(guó)不得以下令封鎖鐵路交通。鐵路交通是經(jīng)濟(jì)發(fā)展的必須條件，封鎖道路，疫戰(zhàn)燃起，呈現(xiàn)一幕幕催人淚下而又舍我其誰(shuí)的英雄兒女。院長(zhǎng)朱立德命令李云龍投入一線救人，臨危受命。

空無(wú)一人的武漢街道上，剛在醫(yī)院出來(lái)的鐘亮神情茫然的走在街上，衣衫襤褸的麥兜和佩奇乘機(jī)將他的畫(huà)偷走了。

鐘亮與失散多年的妻子葉曉重逢，不禁潸然淚下，當(dāng)?shù)弥约旱呐畠禾裉裨诨疖?chē)上感染病毒后，不知所蹤，失聲痛哭。鐘亮原是國(guó)家的醫(yī)學(xué)工程師，由于對(duì)醫(yī)院中以權(quán)謀私的劣行不滿(mǎn)，被腐敗院長(zhǎng)打壓，從此萬(wàn)念俱灰，流落武漢，以畫(huà)畫(huà)為生。為了維持生計(jì)，鐘亮想將自己的畫(huà)賣(mài)給房東朱扒皮，一位落魄的收藏店老板，這時(shí)才發(fā)現(xiàn)畫(huà)不翼而飛。

李云龍的父親從老家來(lái)看望兒子，希望云龍能帶著媳婦和孫子回趟老家看望病重的母親，而李云龍的妻兒在疫情中感染多日，生死不明，李云龍愁得不知如何向父母交代。

麥兜和佩奇躲在一處報(bào)廢廠，發(fā)現(xiàn)了躲在角落一身男孩裝束的鐘文婷。兩人一致認(rèn)定文婷是孤兒，麥兜還給文婷起了個(gè)名子叫小胖墩。半夜，麥兜、佩奇和文婷溜到醫(yī)院偷饅頭，被巡邏的保安帶到李云龍?zhí)帯＠钤讫堊審埩o了他們幾個(gè)饅頭，幾人吃個(gè)飽后非要留下來(lái)當(dāng)護(hù)工，被李云龍趕了出來(lái)，麥兜順手偷走了李云龍的鋼筆。逃跑途中，幾人打濕了衣服，麥兜非要文婷脫了衣服烤烤，遭到文婷拒絕。麥兜認(rèn)為文婷看不起他，不由分說(shuō)強(qiáng)行扒下文婷的衣服，文婷重重的給了他一巴掌哭著跑開(kāi)。

李云龍率隊(duì)開(kāi)始治療被感染的人群，由于從未接觸過(guò)此類(lèi)病毒，令醫(yī)療工作總不得要領(lǐng)，屢屢受挫。在醫(yī)生田雨建議李云龍向醫(yī)學(xué)專(zhuān)家鐘亮求助，但是心灰意冷的鐘亮卻說(shuō)自己現(xiàn)在除了畫(huà)畫(huà)什么都不關(guān)心。

紅十字院長(zhǎng)胡未良企圖研究疫苗，他們打算拉攏鐘亮，遭到鐘亮的斷然拒絕。

武漢待建的火神山醫(yī)院，有十幾個(gè)感染的病人送來(lái)，李云龍立即讓張大彪請(qǐng)鐘亮協(xié)助救人，鐘亮冷漠回絕，張大彪一怒之下伸出右手打在鐘亮的左臉，然而鐘亮并不畏懼，張大彪憤而離去。火神山醫(yī)院人滿(mǎn)為患，鐘亮突然出現(xiàn)，在他的指揮下病人終于安頓好隔離觀察的工作。李云龍向鐘亮表示感謝，鐘亮告訴他，自己是為了救人，并沒(méi)有心思為他做事。

李父看兒子全身心的投入在疫情救人中，無(wú)奈悄悄離去。