本著探究的問題主要有三個：第一，跨國公司在華研發投資與區域創新系統是如何進行聯系和互動的？第二，基于區域創新系統和跨國公司在本區域研發狀況的不同，是否存在具有區域特色的互動發展模型？第三，如何促進有效互動構建相關政策體系？對于第一個問題，通過對現狀和機理的分析，本著提出跨國公司在華研發投資與區域自主創新主要在技術創新層面、知識創新層面、人力資本層面、政府政策層面、中介組織層面等五個層面存在互動。對于第二個問題，本著指出中國東、中、西部地區不僅在引進跨國公司研發投資和區域自主創新現狀上呈現不同特點，而且在二者互動關系上也呈現出不同模式：東部地區“全球示范集聚模式”、西部地區“本地應用互動模式”、中部地區“產業關聯互動模式”。對于第三個問題，本著基于對現有跨國公司在華研發政策詳細深入的分析，厘清政策體系存在的主要問題，認為構建跨國公司在華研發投資與區域自主創新互動的政策體系非常必要。