寶可夢世界，神奧地區(qū)的真砂鎮(zhèn)上。年滿十歲的小紅和小航，作為新人訓(xùn)練家互相競爭展開旅。伴隨他們一起成長的過程，除一位又一位寶可夢訓(xùn)練家，和一位又一位協(xié)調(diào)訓(xùn)練家，還有一位又一位強(qiáng)大的道館首領(lǐng)外。還有喜歡把實力深不可測的傳說寶可夢們，力量據(jù)為己有的神秘地下組織時空團(tuán)。小紅的夢想是成為冠軍，這段旅程中，小紅能否打倒一個又一個強(qiáng)大的道館首領(lǐng)，在神奧大會中最終脫穎而出。從而獲得挑戰(zhàn)傳說中四大天王，和神奧地區(qū)冠軍希羅娜小姐的機(jī)會呢？小紅最終究竟能不能粉碎時空團(tuán)甚至可能毀滅整個世界的計劃？究竟可不可以擊碎希羅娜小姐的不敗金身，就讓我們擦亮眼睛，拭目以待吧…